Kiekvienas pirminis lipoproteinas būdingas tai, kad jo sudėtyje yra tik individas, būdingas baltymas (apolipoproteinas). Apolipoproteinai žymimi lotyniškais raidėmis, iš kurių kai kurie yra baltymų šeima, taip pat nurodomi skaičiai (pvz., Apo-A1, apo-A2 ir kt.).