Analizė atskleidė naujų įrodymų, kad A grupės streptokokų infekcijos paplitimas pasaulyje išaugo

A grupės streptokokas (Strep A) yra dažna bakterijų rūšis, paprastai sukelianti gerklės infekcijas ir skarlatiną. Nors dauguma infekcijų yra lengvos, retais atvejais Streptokokas A gali sukelti invazines infekcijas, kurios gali būti mirtinos.

Nuo 2022 iki 2023 m. visame pasaulyje sveikatos priežiūros tarnybos užfiksavo sunkių invazinių streptokokų A infekcijų padidėjimą panaikinus pandemijos apribojimus. Naujas Londono imperatoriškojo koledžo ir Anglijos visuomenės sveikatos tarnybos mokslininkų tyrimas patvirtino, kad bakterijos variantas, vadinamas M1UK, atliko pagrindinį vaidmenį šiam padidėjimui.

Yra žinoma, kad M1 atmainos sukelia invazyvesnes infekcijas nei kiti A tipo streptokokai. Nors šis variantas pirmą kartą buvo identifikuotas ir sekvenuotas Jungtinėje Karalystėje, neseniai M1UK variantas buvo susietas su padažnėjusiomis sunkiomis infekcijomis Europoje, Australijoje, Šiaurės Amerikoje ir Japonijoje po pandemijos apribojimų panaikinimo. Jis taip pat buvo aptiktas Pietų Amerikoje, Naujojoje Zelandijoje ir Taivane.

Žemas streptokokų A infekcijų lygis pandemijos metu greičiausiai padarė gyventojus, ypač vaikus, ypač pažeidžiamus šioms infekcijoms, o tai prisidėjo prie atvejų skaičiaus padidėjimo daugelyje šalių.

Naujame M1UK genetikos tyrime, paskelbtame žurnale „Nature Communications“, mokslininkai pateikia naujų duomenų apie tai, kada šis variantas pirmą kartą atsirado ir kaip jis atrodo, palyginti su kitomis atmainomis.

M1UK ir tarpinių populiacijų pasaulinis paplitimas ir galimi introdukcijos įvykiai. A Filogenetinis medis, sudarytas iš 2364 M1UK ir tarpinių kamienų, surinktų visame pasaulyje nuo 2005 m. kovo iki 2023 m. liepos mėn. B Supaprastintas perdavimo medis, sukurtas naudojant PastML, rodantis M1UK linijų ir tarpinių populiacijų protėvių epideminės kilmės vietą. C Apskaičiuotas efektyvus M1UK populiacijos dydis (Ne) JK laikui bėgant. „Nature Communications“ (2024). DOI: 10.1038/s41467-024-47929-7

Naudodami pacientų mėginių genetinę seką kartu su kompiuteriniu modeliavimu, jie nustatė, kad M1UK greičiausiai atsirado apie 2008 m. ir pradėjo palaipsniui didėti nuo 2010 m.

Palyginti su ankstesnėmis M1 padermėmis, kurios per pastaruosius 40 metų išliko beveik nepakitusios, M1UK padermė gamina daugiau skarlatiną sukeliančių toksinų.

Profesorė Shiranee Sriskandan iš Londono Imperatoriškojo koledžo Užkrečiamųjų ligų katedros, kuri kartu su kolegomis iš UKHSA vadovavo tyrimui, sakė: „Bakterijos laikui bėgant vystosi, ir kadangi streptokokas A yra grynai žmonėms skirtas patogenas, jis įgyja genetinių pokyčių, plintant populiacijoje. Dauguma variantų atsiranda ir išnyksta laikui bėgant, tačiau M1UK dabar atrodo gerai įsitvirtinęs JK ir kitose šalyse. Ar taip išliks ir ilguoju laikotarpiu, nežinoma.“

Genetinė istorija

Atlikusi paiešką pasaulinėse genomikos duomenų bazėse, komanda parodė, kad kai 2019 m. Jungtinėje Karalystėje pirmą kartą buvo aptiktas M1UK, už JK ribų iš genomo sekų buvo galima identifikuoti tik dvi M1UK padermes. Tačiau vėlesnė analizė iš kitų šalių, nagrinėjanti besikeičiančias A streptokokų infekcijų (įskaitant invazines infekcijas) tendencijas, rodo, kad M1UK dabar aptinkamas daugiau nei 10 pasaulio šalių ir kai kuriais atvejais po pandemijos tapo dominuojančia paderme.

Analizėje taip pat pabrėžiamas kliūties efektas: COVID-19 pandemijos metu, sutapus su plačiai paplitusiomis socialinio atstumo priemonėmis ir karantinais, sumažėjo streptokokų A infekcijų skaičius. Tačiau po šio laikotarpio M1UK virusas sparčiai išplito Jungtinėje Karalystėje, o 2022 m. pastebimai padaugėjo skarlatinos ir invazinių streptokokų A infekcijų.

Pasak tyrėjų, nors sumažėjęs streptokoko A plitimas pandemijos metu galėjo lemti susilpnėjusį populiacijos imunitetą, jų darbas išryškina M1UK genetines ypatybes, kurios rodo išgyvenamumo pranašumą prieš kitas atmainas, leidžiančias jai lengviau plisti ir potencialiai sukelti sunkesnę ligą. Gali būti, kad padidėjęs populiacijos imunitetas M1UK atmainai gali leisti atsirasti kitų tipų atmainoms.

Profesorius Sriskandanas, taip pat Bakterijų atsparumo biologijos centro klinikinis direktorius, pridūrė: „Nors dabar žinome, kad M1UK variantas buvo atsakingas už reikšmingą atvejų skaičiaus padidėjimą praėjusią žiemą, tai įvyko neįprastu metų laiku, sutapus su kvėpavimo takų virusais ir žiemos stresu, kurie visi turėjo įtakos ligos sunkumui. Galiausiai, šuoliai, kuriuos matome skirtingu metu visame pasaulyje, greičiausiai atsiranda dėl sumažėjusio imuniteto tam tikriems kvėpavimo takų patogenams, ypač streptokokui A. Vakcinos galėtų padėti to išvengti, o mums tikrai reikia vakcinos nuo streptokoko A. Šie naujausi mūsų tyrimo rezultatai buvo įmanomi glaudžiai bendradarbiaujant Imperatoriškojo koledžo infekcinių ligų tyrėjams ir JK Sveikatos apsaugos agentūros pasaulyje pirmaujančiai molekulinės stebėsenos sistemai.“