Naujas metodas leis greičiau kurti vaistus

Tarptautinė mokslininkų grupė iš Prancūzijos, Amerikos ir Rusijos sukūrė naują unikalų vaistų kūrimo metodą, kuris nuo šiandien egzistuojančių skiriasi savo greičiu. Dėl naujo baltymų sąveikos modeliavimo metodo bus galima pagreitinti vakcinų ir vaistų kūrimo procesą, o biochemikai taip pat turės naują tyrimų potencialą.

Dabar mokslininkai susiduria su užduotimi sukurti tokius vaistus, kurie nesukeltų šalutinio poveikio, būtų visiškai absorbuojami organizmo ir sunaikintų tik nesveikas ląsteles. Ląstelei baltymai yra pagrindinė statybinė medžiaga, vienoje ląstelėje vyksta daug sąveikų (šimtai tūkstančių), o šių procesų tyrimas leis mokslininkams sukurti naujus pavojingų ligų gydymo metodus, sukurti naujas biologines medžiagas vaistų išradimui.

Įvairių šalių specialistai, vadovaujami Stony Brook universiteto profesoriaus Dmitrijaus Kozakovo, sugebėjo sukurti ir ištirti kompiuterinį modelį, kuris geba kelis kartus greičiau apskaičiuoti dviejų baltymų sąveikos metu susidariusias struktūras (naujasis modelis yra dešimtis kartų greitesnis nei panašios sistemos, egzistuojančios šiandien).

Pasak mokslininkų, laboratoriniai tyrimai yra gana brangūs, nes jiems reikalingi reagentai ir brangi įranga. Mažoms tyrėjų grupėms geriausias pasirinkimas yra kompiuterinis modeliavimas. Šiuo metu yra daug kompiuterinių sistemų, kurios skaičiuoja baltymų sąveiką, tačiau, deja, ne visos esamos sistemos sugeba per trumpą laiką apskaičiuoti didelį skaičių baltymų sąveikų. Visi šiuo metu naudojami algoritmai stebi konfigūracijas atskirai, jų nejungiant, o naujas profesoriaus Kozakovo komandos metodas leidžia per trumpą laiką išanalizuoti visus kompleksus vienu metu, ir tai leidžia pagreitinti procesą iki 100 kartų, nepaveikiant galutinio rezultato kokybės.

Naudodami kompiuterinį modelį kaip pagrindą, specialistai galės ne tik greičiau kurti vaistus, bet ir ženkliai sumažinti jų kainą. Naujasis kompiuterinio modeliavimo metodas leidžia ne tik apskaičiuoti baltymų sąveiką, bet ir analizuoti gyvų organizmų (tiek gyvūnų, tiek žmonių) struktūrą. Specialistų teigimu, naujasis metodas leis sukurti veiksmingus vaistus nuo ŽIV ir onkologinių ligų, o per trumpą laiką bus galima paruošti pakankamą vaistų kiekį.

Mokslininkai viename iš mokslinių žurnalų paskelbė straipsnį su savo darbo rezultatais, kuriame specialistai išsamiai aprašė naują baltymų sąveikos kompiuterinio modeliavimo metodą.

Šis darbas nėra skirtas komerciniam naudojimui, o yra fundamentalus tyrimas, todėl apie atliktą darbą galime kalbėti nuo pat jo pasirodymo mokslinėje publikacijoje momento. Dabar naujas algoritmas jau naudojamas viešajame „ClusPro“ serveryje kaip nauja skaičiavimo sistema ir yra prieinamas visiems.

[ 1 ], [ 2 ], [ 3 ], [ 4 ]