Tyrimas: genai turi įtakos vaisių ir skaidulų veiksmingumui prieš vėžį

Neseniai žurnale „eBioMedicine“ paskelbtame tyrime nustatyti genetiniai variantai, kurie gali pakeisti ryšį tarp skaidulų, vaisių ir daržovių vartojimo bei kolorektalinio vėžio (CRC) rizikos. Tyrėjai sėkmingai nustatė du reikšmingus lokusus, kurie keičia ryšį tarp skaidulų ir vaisių vartojimo bei CRC rizikos.

KRV yra vienas iš labiausiai paplitusių vėžio tipų pasaulyje. 2020 m. užregistruota beveik du milijonai naujų atvejų ir daugiau nei 900 000 mirčių. Pranešama, kad didelis vaisių, daržovių, neskaldytų grūdų ir maistinių skaidulų vartojimas sumažina KRV riziką. Nors yra tvirtų įrodymų apie ryšį tarp KRV rizikos ir neskaldytų grūdų bei maistinių skaidulų vartojimo, įrodymų apie ryšį tarp KRV rizikos ir vaisių bei daržovių vartojimo vis dar yra nedaug.

Ankstesni viso genomo asociacijų tyrimai (GWAS) nustatė mažiausiai 200 su KRV rizika susijusių lokusų, paaiškinančių iki 35 % paveldimumo. Nors genų ir aplinkos (G × E) sąveika gali paaiškinti papildomą paveldimumą, ankstesni tyrimai su mažomis imtimis ir tradiciniais metodais nustatė tik ribotą skaičių reikšmingų sąveikų. Nauji statistiniai metodai, tokie kaip jungtiniai testai ir dviejų pakopų metodai, kurie teikia pirmenybę vieno nukleotido polimorfizmams (SNP), gali pagerinti šių analizių tikslumą.

Į analizę buvo įtraukta iki 45 tyrimų, atliktų trijų KLK genetinių konsorciumų, įskaitant europiečių kilmės asmenis. Tyrimuose buvo įtrauktos atvejo-kontrolės grupės kohortiniams tyrimams ir vėžio neturinčių asmenų kontrolės grupės atvejo-kontrolės tyrimams. Iš viso buvo analizuojami atitinkamai 69 599, 69 734 ir 44 890 dalyvių vaisių, daržovių ir skaidulų suvartojimas. Mitybos suvartojimas buvo įvertintas naudojant maisto vartojimo dažnumo klausimynus ir mitybos istorijas, paprastai išreiškiant vaisių ir daržovių porcijomis per dieną ir bendrų skaidulų gramais per dieną.

Duomenys buvo suderinti ir išreikšti kaip kvartilinės vertės pagal lytį ir tyrimą. Be to, genotipų nustatymo kokybės kontrolė apėmė trūkstamų duomenų, Hardy-Weinbergo pusiausvyros ir lyčių neatitikimo patikrinimą, po kurio buvo atlikta imputacija ir filtravimas pagal mažesnių alelių dažnį ir tikslumą, todėl buvo išanalizuoti 7 250 911 SNP.

Palyginti su kontroline grupe, dalyviai, sergantys kolorektaliniu vėžiu (VTK), buvo vyresni, turėjo didesnį kūno masės indeksą ir energijos suvartojimą, taip pat didesnį rizikos veiksnių, tokių kaip VTK šeimos anamnezė ir 2 tipo diabetas, paplitimą. Jie taip pat vartojo mažiau skaidulų, vaisių ir daržovių, palyginti su kontroline grupe. Metaanalizės nustatė atvirkštinį ryšį tarp skaidulų (santykinė rizika kvartiliui (OR) = 0,79), vaisių (OR = 0,79) ir daržovių (OR = 0,82) vartojimo ir VT rizikos.

3-DF testu nustatytas rs4730274 lokusas prieš SLC26A3 geną, kuris rodo ryšį su skaidulų vartojimu ir sąveiką su KRV rizika. Stratifikacija pagal genotipą parodė stipresnį atvirkštinį ryšį tarp skaidulų ir KRV kiekvienos T alelio kopijos atveju. Funkcinė anotacija parodė sustiprinto aktyvumą gaubtinės žarnos audiniuose, o DLD genui – eQTL.

Šalia NEGR1 geno esantis rs1620977 lokusas parodė reikšmingą ryšį su vaisių vartojimu ir vidutinę sąveiką su KRV rizika. Stiprus atvirkštinis ryšys buvo pastebėtas didėjant vaisių vartojimui kiekvienai G alelio kopijai.

Tai didžiausias iki šiol atliktas G×E tyrimas, kuriame tyrėjai nustatė dvi sąveikas tarp skaidulų vartojimo, vaisių vartojimo ir kolorektalinio vėžio (KTR) rizikos. Tiksliau, rs4730274 mutacija šalia SLC26A3 geno rodo reikšmingą ryšį tarp skaidulų vartojimo, žarnyno funkcijos, uždegimo ir TRT. Gauti rezultatai reikalauja tolesnių tyrimų, siekiant ištirti klinikinę reikšmę ir patvirtinti šiuos rezultatus skirtingose populiacijose.