6 tipo herpesvirusas laikomas labiausiai tikėtinu išsėtinės sklerozės, naujagimių konvulsinės karštinės ir infekcinės mononukleozės, Epstein-Barr viruso ir citomegaloviruso neigiamų infekcijų bei su HHV-6 susijusio encefalito etiologiniu agentu. HHV-6 yra AIDS, kai kurių gimdos kaklelio karcinomos formų ir nosiaryklės karcinomos kofaktorius.