Ypatingas dėmesys gydant patologijas šlapimo takų sistemoje skiriamas vaistų terapijai. Vaistą, skirtą gimdos kaklelio cistatui, pasirenka gydantis gydytojas, remdamasis tyrimų rezultatais, ligos tipu, jo stadija, paciento kūno charakteristika ir keletas kitų veiksnių.