HCV genomą reprezentuoja viengrandė teigiamai įkrauta RNR, kuri koduoja 3 struktūrinius (nukleokapsidės baltymo šerdis ir apvalkalo E1-E2 nukleoproteinai) ir 5 struktūrinius (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) baltymus. Kiekvienam iš šių baltymų, esančių virusiniu hepatitu C sergančių pacientų kraujyje, sintetinami AT.