MRT analizuoja smegenų struktūrų būklę pagal jų formą, dydį ir audinių tankį. Atkreipkite dėmesį, kad MRT atspindi audinių tankį kaip vandens kiekio funkcija, todėl pirmasis aptikti pažeidimai, pavyzdžiui, smegenų edema, patinimas (ONGM) demielinizuojančia ligų, auglių.