Inkubacinis laikotarpis hepatito B trunka 60-180 dienas, paprastai 2-4 mėnesius, retais atvejais, tai yra sutrumpintas iki 30-45 dienų, arba galima perkelti į 225 dienų. Inkubacijos laikotarpis priklauso nuo infekcinės dozės ir vaikų amžiaus. Kai masinis infekcija (perpilant kraują ar plazmą) inkubacinis laikotarpis yra trumpas - 1,5-2 mėnesius, o už parenteriniu manipuliacijų (po oda ir švirkšti į raumenis), o ypač namų ūkių infekcijos inkubacinis periodas 4-6 mėnesius.