Trombozės apatinių galūnių giliųjų venų gydymas yra daugiausiai skirti plaučių embolijos profilaktikai, ir, antra, - simptomų, sumažinimo, lėtinių venų nepakankamumo ir postflebiticheskogo sindromas. Giliųjų venų trombozė apatinių ir viršutinių galūnių gydymui paprastai yra tokia pati.