Encefalitas su vėjaraupiais yra rimta infekcinė-alerginė liga. Venerinių raupų encefalitas išsivysto 3-7 dienomis po bėrimų atsiradimo. Retais atvejais encefalitas pasireiškia vėlesniais laikotarpiais arba iki eplampo laikotarpiu. Yra hipertermija, koma, traukuliai, meninginiai simptomai, piramidės ir ekstrapiramidiniai sutrikimai.