Vėjaraupių encefalitas yra sunki infekcinė-alerginė liga. Vėjaraupių encefalitas išsivysto 3–7 dieną po bėrimo atsiradimo. Retai encefalitas pasireiškia vėliau arba preegzantemos laikotarpiu. Pasireiškia hipertermija, koma, traukuliai, meninginiai simptomai, piramidiniai ir ekstrapiramidiniai sutrikimai.