Pacientams, kuriems nėra nustatyto smegenų infarkto, heparinas skiriamas kaip boliusas 2500–5000 vienetų doze, kad būtų pasiektas greitesnis poveikis. Dalinis tromboplastino laikas turėtų būti matuojamas kas 4 valandas, kol indikatorius stabilizuojasi. Dėl intrakranijinių hemoraginių komplikacijų rizikos pacientams, sergantiems infarktu, infuzija pradedama be pradinio boliuso.